REALISATION D'OUTILS LOGICIELS POUR LA CRISTALLOGRAPHIE DES MACROMOLECULES BIOLOGIQUES PDF Download
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Author: ALAIN.. ROUSSEL
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Languages : fr
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LA CRISTALLOGRAPHIE DES MACROMOLECULES BIOLOGIQUES PERMET D'OBTENIR, A PARTIR DU SPECTRE DE DIFFRACTION AUX RAYONS X DE MONOCRISTAUX, LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE L'OBJET BIOLOGIQUE. ELLE COMPORTE QUATRE ETAPES PRINCIPALES: LA CRISTALLOGENESE, L'ENREGISTREMENT DU SPECTRE DE DIFFRACTION, L'OBTENTION DES PHASES ET LA CONSTRUTION DU MODELE. CE TRAVAIL DECRIT LA CONCEPTION DE LOGICIELS POUR LES PREMIERE ET DERNIERE ETAPES. DANS LA PREMIERE PARTIE, NOUS AVONS ECRIT UN LOGICIEL D'INTERROGATION EN LANGAGE NATUREL (ANGLAIS) D'UNE BASE DE DONNEES DE CRISTALLISATIONS DE MACROMOLECULES BIOLOGIQUES. NOUS AVONS FAIT UN ETUDE STATISTIQUE SUR L'UTILISATION DES DIFFERENTS AGENTS PRECIPITANTS. NOUS AVONS ENSUITE REALISE UN PROGRAMME D'ANALYSE DES CONTACTS CRISTALLINS INTERMOLECULAIRES. NOUS AVONS COMPARE CES INTERACTIONS AVEC CELLES EXISTANT A L'ETAT NATUREL DANS LES MULTIMERES PROTEIQUES. LA DEUXIEME PARTIE DE CE TRAVAIL A ETE CONSACREE A LA REALISATION DE LOGICIELS DE GRAPHISME MOLECULAIRE. NOUS AVONS TOUT D'ABORD ECRIT UNE OPTION PERMETTANT DE REPRESENTER, D'EDITER ET DE MANIPULER LES MOLECULES RELIEES PAR SYMETRIE SUR UN ECRAN GRAPHIQUE. PUIS NOUS AVONS REALISE, DE NOVO, UN LOGICIEL COMPLET DE GRAPHISME MOLECULAIRE: TURBO-FRODO. CE LOGICIEL EST FONDE SUR UNE BASE DE DONNEES ARBORESCENTE. IL PERMET LA MODELISATION ET LA CONSTRUCTION DE MODELES DE MACROMOLECULES DANS DES CARTES DE DENSITE ELECTRONIQUE. LA FACILITE D'UTILISATION ET LA DIVERSITE DES OPTIONS FONT DE CE LOGICIEL UN OUTIL POUR LA CRISTALLOGRAPHIE ET AUSSI POUR LA BIOLOGIE MOLECULAIRE STRUCTURALE
Author: ALAIN.. ROUSSEL
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Languages : fr
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Book Description
LA CRISTALLOGRAPHIE DES MACROMOLECULES BIOLOGIQUES PERMET D'OBTENIR, A PARTIR DU SPECTRE DE DIFFRACTION AUX RAYONS X DE MONOCRISTAUX, LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE L'OBJET BIOLOGIQUE. ELLE COMPORTE QUATRE ETAPES PRINCIPALES: LA CRISTALLOGENESE, L'ENREGISTREMENT DU SPECTRE DE DIFFRACTION, L'OBTENTION DES PHASES ET LA CONSTRUTION DU MODELE. CE TRAVAIL DECRIT LA CONCEPTION DE LOGICIELS POUR LES PREMIERE ET DERNIERE ETAPES. DANS LA PREMIERE PARTIE, NOUS AVONS ECRIT UN LOGICIEL D'INTERROGATION EN LANGAGE NATUREL (ANGLAIS) D'UNE BASE DE DONNEES DE CRISTALLISATIONS DE MACROMOLECULES BIOLOGIQUES. NOUS AVONS FAIT UN ETUDE STATISTIQUE SUR L'UTILISATION DES DIFFERENTS AGENTS PRECIPITANTS. NOUS AVONS ENSUITE REALISE UN PROGRAMME D'ANALYSE DES CONTACTS CRISTALLINS INTERMOLECULAIRES. NOUS AVONS COMPARE CES INTERACTIONS AVEC CELLES EXISTANT A L'ETAT NATUREL DANS LES MULTIMERES PROTEIQUES. LA DEUXIEME PARTIE DE CE TRAVAIL A ETE CONSACREE A LA REALISATION DE LOGICIELS DE GRAPHISME MOLECULAIRE. NOUS AVONS TOUT D'ABORD ECRIT UNE OPTION PERMETTANT DE REPRESENTER, D'EDITER ET DE MANIPULER LES MOLECULES RELIEES PAR SYMETRIE SUR UN ECRAN GRAPHIQUE. PUIS NOUS AVONS REALISE, DE NOVO, UN LOGICIEL COMPLET DE GRAPHISME MOLECULAIRE: TURBO-FRODO. CE LOGICIEL EST FONDE SUR UNE BASE DE DONNEES ARBORESCENTE. IL PERMET LA MODELISATION ET LA CONSTRUCTION DE MODELES DE MACROMOLECULES DANS DES CARTES DE DENSITE ELECTRONIQUE. LA FACILITE D'UTILISATION ET LA DIVERSITE DES OPTIONS FONT DE CE LOGICIEL UN OUTIL POUR LA CRISTALLOGRAPHIE ET AUSSI POUR LA BIOLOGIE MOLECULAIRE STRUCTURALE
Author: ANNE-GAEL.. INISAN
Publisher:
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Category :
Languages : fr
Pages : 158
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LA CRISTALLOGRAPHIE AUX RAYONS-X ET LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE MULTIDIMENSIONNELLE SONT DEUX METHODES DE RESOLUTION DE STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES DE MACROMOLECULES BIOLOGIQUES. TOUTES DEUX NE SE CONCOIVENT PLUS DESORMAIS SANS L'AIDE DE L'INFORMATIQUE, NOTAMMENT UNE AIDE LOGICIELLE. C'EST AINSI QUE CETTE THESE A FAIT L'OBJET DE DEVELOPPEMENTS DE LOGICIELS D'AIDE A LA RESOLUTION DE STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES. EN PREMIERE PARTIE, LE DEVELOPPEMENT D'UNE INTERFACE 'PETITES MOLECULES' DANS UN LOGICIEL DE MODELISATION MOLECULAIRE DEJA EXISTANT: TURBO-FRODO, EST PRESENTE. CETTE INTERFACE A ETE DEVELOPPEE DANS LE BUT DE DONNER AUX CRISTALLOGRAPHES LA POSSIBILITE D'ETUDIER DES COMPLEXES MACROMOLECULES-LIGAND DANS LA CARTE DE DENSITE ELECTRONIQUE. ELLE COMPORTE DEUX PARTIES: UNE PASSERELLE ENTRE TURBO-FRODO ET UNE BANQUE DE DONNEES DE PETITES MOLECULES: LA CAMBRIDGE STRUCTURAL DATABASE ; ET UN CONSTRUCTEUR GEOMETRIQUE DE PETITES MOLECULES. LA SECONDE PARTIE CONCERNE LE DEVELOPPEMENT D'UN LOGICIEL D'ATTRIBUTION DE SPECTRES BIDIMENSIONNELS DE RMN: TURBO-NMR. CE LOGICIEL, ENTIEREMENT GRAPHIQUE, PERMET L'INTERPRETATION DES SPECTRES, EN PROPOSANT LA VISUALISATION DES SPECTRES, UNE TENUE DE NOTES INTERACTIVE ET DES ROUTINES SEMI-AUTOMATIQUES D'ATTRIBUTION. ENFIN, CE LOGICIEL A ETE UTILISE POUR RESOUDRE LA STRUCTURE D'UN ANALOGUE D'UNE NEUROTOXINE DE SCORPION (31 ACIDES AMINES) ; PUIS, POUR ATTRIBUER LES SPECTRES DU DOMAINE HEMIQUE DU FLAVOCYTOCHROME B#2 DE LEVURE (99 ACIDES AMINES)
Author:
Publisher: Ed. Techniques Ingénieur
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 20
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Author: Le Du Marie-Hélène
Publisher: EDP Sciences
ISBN: 2759825507
Category : Technology & Engineering
Languages : fr
Pages : 182
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Dans le monde du vivant, les mécanismes mis en jeu pour respirer, digérer, grandir, bouger, impliquent des molécules constituées de milliers d’atomes, ce sont les macromolécules. Ces macromolécules circulent, interagissent et se contorsionnent en permanence. Les visualiser à l’échelle atomique constitue une aide incomparable pour comprendre comment elles fonctionnent ou dysfonctionnent, et pour concevoir des médicaments. Les auteurs vous proposent une initiation aux différentes étapes de la cristallographie biologique qui mène de la cristallisation à la structure tridimensionnelle d’une macromolécule. Ce livre fait suite au MOOC « Voyage au cœur du vivant avec des rayons X : la cristallographie ». Il peut en être le compagnon ou être utilisé seul.
Author:
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ISBN: 9782759824540
Category :
Languages : fr
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Author: D. J. Jeffries
Publisher:
ISBN:
Category : Medical
Languages : en
Pages : 614
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Considerable advances have been made in the treatment of antiviral diseases over the last decade. Several new drugs have been introduced while new clinical information has been gathered on the efficacy of existing drugs. This study aims to provide an examination of the basic science (drug formulae, structure and biochemical activity) and clinical information (usage and efficacy) on chemotherapy, as well as describing future potentials.
Author:
Publisher: Elsevier
ISBN: 012408107X
Category : Science
Languages : en
Pages : 593
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Advances in Botanical Research publishes in-depth and up-to-date reviews on a wide range of topics in plant sciences. The series features several reviews by recognized experts on all aspects of plant genetics, biochemistry, cell biology, molecular biology, physiology and ecology. This thematic volume, number 71, features reviews on sea plants. Its chapters cover topics such as the role of algae in sustainability; the status of kelp exploitation and marine agronomy; potential applications for enzymatic recovery of metabolites from seaweeds; and many more. - Publishes in-depth and up-to-date reviews on a wide range of topics in plant sciences - Features a wide range of reviews by recognized experts on all aspects of plant genetics, biochemistry, cell biology, molecular biology, physiology, and ecology - Volume features reviews on sea plants
Author: Ursula Jakob
Publisher: Springer Science & Business Media
ISBN: 9400757875
Category : Science
Languages : en
Pages : 488
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Many physiological conditions such as host defense or aging and pathological conditions such as neurodegenerative diseases, and diabetes are associated with the accumulation of high levels of reactive oxygen species and reactive nitrogen species. This generates a condition called oxidative stress. Low levels of reactive oxygen species, however, which are continuously produced during aerobic metabolism, function as important signaling molecules, setting the metabolic pace of cells and regulating processes ranging from gene expression to apoptosis. For this book we would like to recruit the experts in the field of redox chemistry, bioinformatics and proteomics, redox signaling and oxidative stress biology to discuss how organisms achieve the appropriate redox balance, the mechanisms that lead to oxidative stress conditions and the physiological consequences that contribute to aging and disease.
Author: Isabelle Mus-Veteau
Publisher: Springer
ISBN: 9781493948062
Category : Science
Languages : en
Pages : 0
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This book updates the latest development in production, stabilization and structural analysis techniques of membrane proteins. This field has made significant advances since the elucidation of the first 3-D structure of a recombinant G Protein Coupled Receptor (GPCR), rhodopsin, with the structure of several more GPCRs having been solved in the past five years. In fact, the 2012 Nobel Prize in Chemistry was awarded for groundbreaking discoveries on the inner workings of GPCRs. This book is essential reading for all researchers, biochemists and crystallographers working with membrane proteins, who are interested by the structural characterization of their favorite protein and who wish to follow the expression, migration, modifications and recycling of a membrane protein.
Author: Agnes Buka
Publisher: World Scientific
ISBN: 1848167997
Category : Science
Languages : en
Pages : 299
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The book intends to give a state-of-the-art overview of flexoelectricity, a linear physical coupling between mechanical (orientational) deformations and electric polarization, which is specific to systems with orientational order, such as liquid crystals. Chapters written by experts in the field shed light on theoretical as well as experimental aspects of research carried out since the discovery of flexoelectricity. Besides a common macroscopic (continuum) description the microscopic theory of flexoelectricity is also addressed. Electro-optic effects due to or modified by flexoelectricity as well as various (direct and indirect) measurement methods are discussed. Special emphasis is given to the role of flexoelectricity in pattern-forming instabilities. While the main focus of the book lies in flexoelectricity in nematic liquid crystals, peculiarities of other mesophases (bent-core systems, cholesterics, and smectics) are also reviewed. Flexoelectricity has relevance to biological (living) systems and can also offer possibilities for technical applications. The basics of these two interdisciplinary fields are also summarized.
