Méthodes fluorescentes d'analyse du génome PDF Download
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Author: Isabelle Henrion
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Category :
Languages : fr
Pages : 212
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Author: Isabelle Henrion
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Languages : fr
Pages : 212
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Author: Isabelle Leger
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Category :
Languages : fr
Pages : 223
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LES TRAVAUX PRESENTES DANS CETTE THESE S'INTEGRENT DANS LE PROJET EUROPEEN HUMAN GENOME; ILS S'INSCRIVENT PLUS PRECISEMENT DANS LE CONTEXTE DE L'ANALYSE IN SITU DE L'ORGANISATION DU GENOME HUMAIN. AVEC POUR OBJECTIF DE DEVELOPPER DES APPROCHES ORIGINALES DE CARTOGRAPHIE PHYSIQUE ET FONCTIONNELLE, NOUS AVONS MIS AU POINT DES METHODES D'ANALYSE INTERACTIVE D'IMAGES DE SONDES HYBRIDEES IN SITU ADAPTEES A L'ORDONNANCE LINEAIRE DE GENES SUR LA MOLECULE D'ADN ET A L'ETUDE DE LA DISTRIBUTION DE SEQUENCES GENOMIQUES DANS LE NOYAU CELLULAIRE INTERPHASIQUE. TIRANT PROFIT DES AVANTAGES DU SYSTEME HOME (HIGHLY OPTIMIZED MICROSCOPE ENVIRONMENT) APPLIQUE A LA MICROSCOPIE EN FLUORESCENCE, SEPT GENES CODANT POUR DES PROTEINES EN DOIGTS DE ZINC ONT ETE ORDONNES SUR LE CHROMOSOME 19 PAR CARTOGRAPHIE INTERPHASIQUE. SI L'ADEQUATION DU SYSTEME HOME POUR CETTE APPROCHE CARTOGRAPHIQUE EST CONFIRMEE, NOUS SERONS A MEME DE FOURNIR UNE METHODE ADAPTEE A LA LOCALISATION PRECISE ET RAPIDE DE SEQUENCES SPECIFIQUES SUR LE GENOME, RAPPROCHANT AINSI PAR UN RACCOURCI OPERATIONNEL APPRECIABLE, LES ACQUIS DE LA GENETIQUE MOLECULAIRE ET DE LA CYTOGENETIQUE POUR UNE CONNAISSANCE CARTOGRAPHIQUE ACCELEREE DU GENOME HUMAIN. DANS LA PERSPECTIVE D'OUVRIR DE NOUVELLES VOIES D'INVESTIGATION POUR L'ANALYSE DES RELATIONS SPATIALES ET FONCTIONNELLES ADN-PROTEINES DANS LE NOYAU INTERPHASIQUE, NOUS AVONS DEVELOPPE UNE TECHNIQUE COMBINANT L'HYBRIDATION IN SITU DE SONDES FLUORESCENTES ET LA DETECTION IMMUNO-CYTOCHIMIQUE DE PROTEINES NUCLEAIRES. LA CO-LOCALISATION DU CENTROMERE DU CHROMOSOME 1 ET DES NUCLEOLES A AINSI ETE MISE EN EVIDENCE DANS UNE LIGNEE CELLULAIRE DE CANCER DU SEIN DONT LES CARACTERISTIQUES GENETIQUES AVAIENT ETE PREALABLEMENT DETERMINEES PAR LA CYTOGENETIQUE INTERPHASIQUE. L'ANALYSE INTERACTIVE DES IMAGES OBTENUES APRES DOUBLE MARQUAGE, NOUS A PERMIS DE DOCUMENTER LA SIGNIFICATION FONCTIONNELLE DE L'ASSOCIATION ENTRE LE CHROMOSOME 1 ET LES NUCLEOLES
Author: ISABELLE.. LEGER
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Languages : fr
Pages : 0
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LES TRAVAUX PRESENTES DANS CETTE THESE S'INTEGRENT DANS LE PROJET EUROPEEN HUMAN GENOME; ILS S'INSCRIVENT PLUS PRECISEMENT DANS LE CONTEXTE DE L'ANALYSE IN SITU DE L'ORGANISATION DU GENOME HUMAIN. AVEC POUR OBJECTIF DE DEVELOPPER DES APPROCHES ORIGINALES DE CARTOGRAPHIE PHYSIQUE ET FONCTIONNELLE, NOUS AVONS MIS AU POINT DES METHODES D'ANALYSE INTERACTIVE D'IMAGES DE SONDES HYBRIDEES IN SITU ADAPTEES A L'ORDONNANCE LINEAIRE DE GENES SUR LA MOLECULE D'ADN ET A L'ETUDE DE LA DISTRIBUTION DE SEQUENCES GENOMIQUES DANS LE NOYAU CELLULAIRE INTERPHASIQUE. TIRANT PROFIT DES AVANTAGES DU SYSTEME HOME (HIGHLY OPTIMIZED MICROSCOPE ENVIRONMENT) APPLIQUE A LA MICROSCOPIE EN FLUORESCENCE, SEPT GENES CODANT POUR DES PROTEINES EN DOIGTS DE ZINC ONT ETE ORDONNES SUR LE CHROMOSOME 19 PAR CARTOGRAPHIE INTERPHASIQUE. SI L'ADEQUATION DU SYSTEME HOME POUR CETTE APPROCHE CARTOGRAPHIQUE EST CONFIRMEE, NOUS SERONS A MEME DE FOURNIR UNE METHODE ADAPTEE A LA LOCALISATION PRECISE ET RAPIDE DE SEQUENCES SPECIFIQUES SUR LE GENOME, RAPPROCHANT AINSI PAR UN RACCOURCI OPERATIONNEL APPRECIABLE, LES ACQUIS DE LA GENETIQUE MOLECULAIRE ET DE LA CYTOGENETIQUE POUR UNE CONNAISSANCE CARTOGRAPHIQUE ACCELEREE DU GENOME HUMAIN. DANS LA PERSPECTIVE D'OUVRIR DE NOUVELLES VOIES D'INVESTIGATION POUR L'ANALYSE DES RELATIONS SPATIALES ET FONCTIONNELLES ADN-PROTEINES DANS LE NOYAU INTERPHASIQUE, NOUS AVONS DEVELOPPE UNE TECHNIQUE COMBINANT L'HYBRIDATION IN SITU DE SONDES FLUORESCENTES ET LA DETECTION IMMUNO-CYTOCHIMIQUE DE PROTEINES NUCLEAIRES. LA CO-LOCALISATION DU CENTROMERE DU CHROMOSOME 1 ET DES NUCLEOLES A AINSI ETE MISE EN EVIDENCE DANS UNE LIGNEE CELLULAIRE DE CANCER DU SEIN DONT LES CARACTERISTIQUES GENETIQUES AVAIENT ETE PREALABLEMENT DETERMINEES PAR LA CYTOGENETIQUE INTERPHASIQUE. L'ANALYSE INTERACTIVE DES IMAGES OBTENUES APRES DOUBLE MARQUAGE, NOUS A PERMIS DE DOCUMENTER LA SIGNIFICATION FONCTIONNELLE DE L'ASSOCIATION ENTRE LE CHROMOSOME 1 ET LES NUCLEOLES.
Author: DORRA.. CHERIF
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Category :
Languages : fr
Pages : 282
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NOTRE TRAVAIL EST UNE CONTRIBUTION A L'ETUDE DU GENOME HUMAIN A L'AIDE DES TECHNIQUES D'HYBRIDATION IN SITU FLUORESCENTE SUR CHROMOSOMES. LA PREMIERE PARTIE A ETE CONSACREE A LA MISE AU POINT DE L'HYBRIDATION IN SITU COMME METHODE DE CARTOGRAPHIE PHYSIQUE DU GENOME. LA LOCALISATION DE SEQUENCES D'ADN PEU OU MOYENNEMENT AMPLIFIEES, NOUS A PERMIS D'ETUDIER L'EVOLUTION DE L'AMPLIFICATION DE L'ONCOGENE MYC DANS DES LIGNEES TUMORALES, ET DE METTRE EN EVIDENCE UN PHENOMENE INATTENDU DE TRANSPOSITION DES SEGMENTS V#H DES GENES DES IMMUNOGLOBULINES. QUANT AUX SEQUENCES UNIQUES D'ADN, NOUS POUVONS LES DETECTER AVEC DES SONDES D'ADN > 1 KB. LA MISE EN POINT D'UN SYSTEME DE BANDES FLUORESCENTES, PERMETTANT DE VISUALISER SIMULTANEMENT LE SIGNAL D'HYBRIDATION ET LES BANDES R, A FACILITE L'UTILISATION COURANTE DE CETTE METHODE POUR LA CARTOGRAPHIE. NOUS AVONS AINSI ETABLI UNE CARTE PARTIELLE DU CHROMOSOME 11Q AVEC UNE SOIXANTAINE DE MARQUEURS, DONT LA MOITIE SONT LOCALISE DANS LA REGION 11Q22-Q23, CONTENANT LE GENE DE L'ATAXIE TELANGIECTASIE (AT). L'ORDRE DE CERTAINS MARQUEURS LOCALISES DANS LA REGION AT A ETE PRECISE PAR CARTOGRAPHIE SUR NOYAUX EN INTERPHASE. C'EST COMME OUTIL D'ANALYSE CYTOGENETIQUE DES CELLULES CANCEREUSES QUE L'HYBRIDATION IN SITU A ETE DEVELOPPEE DANS LA DEUXIEME PARTIE DE NOTRE TRAVAIL. NOUS AVONS PRIS COMME MODELE LES REARRANGEMENTS DE LA BANDE 11Q23 DANS LES LEUCEMIES AIGUES A MONOCYTES (LAM-M5). DES TRANSLOCATIONS DIFFICILES A ANALYSER PAR LES TECHNIQUES DE BANDES ONT PU ETRE MIS EN EVIDENCE, ET LA POSITION DE CERTAINS POINTS DE CASSURE A ETE PRECISEE. EN COMBINANT HYBRIDATION IN SITU ET ANALYSE MOLECULAIRE, DES DELETIONS DES SEQUENCES SITUEES EN 3' PAR RAPPORT AU SEGMENT CONTENANT LES POINTS DE CASSURE DES TRANSLOCATIONS 11Q23, ONT ETE RETROUVEES DANS PLUS DU QUART DES CAS, SUGGERANT L'IMPLICATION D'UN HYPOTHETIQUE GENE SUPRESSEUR DE TUMEUR DANS LE PROCESSUS LEUCEMOGENE
Author: Peter Lichter
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Category :
Languages : en
Pages : 208
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Author: Marlène Bras
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 163
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L'analyse des gènes est un sujet au cœur de l'actualité. Les grandes avancées de la biologie moléculaire de ces dernières années étaient limitées par le décryptage des séquences d'ADN. Les biopuces basées sur le principe de la reconnaissance de la molécule d'ADN permettent d'accéder à ce type d'informations et sont développées depuis quelques années. Le travail effectué au cours de cette thèse s'inscrit dans le cadre du projet ROSA dont le but est de mettre au point un outil d'analyse performant. La principale technique de détection utilisée pour la lecture des puces à ADN est la spectroscopie de fluorescence. Une présentation des différents types de puces à ADN ainsi que du principe de la fluorescence nous conduit à dégager les différents problèmes posés. Dans un premier temps, la validation des différentes étapes de fabrication, par synthèse directe, ou par accrochage d'oligonucléotides présynthétisés, ainsi que la comparaison de différents types de fonctionnalisation du support, permettent de choisir les conditions les mieux adaptées à l'obtention d'une puce fonctionnelle. Dans un deuxième temps, l'utilisation d'un substrat en silicium avec une épaisseur d'oxyde "accordée" à la longueur d'onde d'excitation entraîne la diminution de la limite de détection de la lecture des puces à ADN par fluorescence, facteur limitant cette technique. Enfin, la reproductibilité et la capacité de réutilisation des différents types de support montrent la fiabilité de la fabrication et les performances de la technique de lecture. Nous avons également tenté de poser les bases d'une analyse quantitative.
Author: Jean-François Morot-Gaudry
Publisher: Editions Quae
ISBN: 9782738011671
Category : Science
Languages : en
Pages : 356
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Cet ouvrage illustre de façon claire et pédagogique les méthodes et les concepts qui sont à la base des progrès de la génomique en biologie végétale (grands programmes internationaux de séquençage, outils de la bio-informatique, méthodes d'analyse de l'expression des gènes incluant leurs produits métaboliques finaux et leur spécificité tissulaire et/ou cellulaire). Il rend compte des applications potentielles de la génomique dans les domaines de la génétique et de l'amélioration des plantes, de l'écophysiologie et de l'agronomie. Ce livre s'adresse aux étudiants de fin d'études universitaires ou agronomiques, aux professeurs de l'enseignement supérieur, aux techniciens, aux ingénieurs et scientifiques qui souhaitent acquérir des connaissances en génomique végétale.
Author:
Publisher:
ISBN:
Category : Cytogenetics
Languages : en
Pages :
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Author:
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ISBN:
Category : Biology
Languages : en
Pages : 672
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Author: Bernd W. Rautenstrauß
Publisher: Elsevier
ISBN: 9783540672760
Category : Medical
Languages : en
Pages : 508
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Book Description
Fluorescence in situ hybridization (FISH) has been developed as a powerful technology which allows direct visualisation or localisation of genomic alterations. The technique has been adopted to a range of applications in both medicine, especially in the areas of diagnostic cytogenetics, and biology. Topics described in this manual include: FISH on native human tissues, such as blood, bone marrow, epithelial cells, hair root cells, amniotic fluid cells, human sperm cells; FISH on archival human tissues, such as formalin fixed and paraffin embedded tissue sections, cryofixed tissue; simultaneous detection of apoptosis and xpression of apoptosis-related genes; comparative genomic ybridization; and special FISH techniques.
