Analyse du rôle des composantes de la diversité sur le fonctionnement des écosystèmes marins benthiques intertidaux

Analyse du rôle des composantes de la diversité sur le fonctionnement des écosystèmes marins benthiques intertidaux PDF Author: Julie Lemieux
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Analyse du rôle des composantes de la diversité sur le fonctionnement des écosystèmes marins benthiques intertidaux

Analyse du rôle des composantes de la diversité sur le fonctionnement des écosystèmes marins benthiques intertidaux PDF Author: Julie Lemieux
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Diversité et fonctions de systèmes écologiques marins

Diversité et fonctions de systèmes écologiques marins PDF Author: André Monaco
Publisher: ISTE Group
ISBN: 1784050059
Category : Marine ecology
Languages : fr
Pages : 431

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La série Mer et Océan propose une approche interdisciplinaire et intégrée (biologique, physique, chimique) des systèmes océaniques : état et fonctionnement des océans, origine de leur vulnérabilité, scénarios de gestion durable et d’adaptation des sociétés. Une approche qui permet le passage de cette science fondamentale, basée sur l’analyse des processus, leurs couplages à toutes les échelles et entre tous les compartiments, à une science « publique », finalisable et participative, ouverte aux décideurs et aux gestionnaires. Dans une perspective de gestion durable, les équilibres entre dynamiques écologiques, sociales et économiques sont désormais au cœur des stratégies de modélisation écologique et de scénarisation environnementale. Diversité et fonctions de systèmes écologiques marinsillustre la biodiversité, la diversité des habitats, des structures et des réseaux trophiques dans différents océans de la planète et systèmes : écosystèmes pélagiques et benthiques, récifs coralliens et herbiers, oasis des sources hydrothermales des dorsales ou zones riches d’upwelling. Des méthodes appropriées d’observations, de suivis à long terme et de modélisation révèlent la complexité des systèmes, des interactions trophiques et des dynamiques spatio-temporelles. L’approche écosystémique est une condition indispensable pour évaluer l’état de ces systèmes, de leurs ressources vivantes et des services écologiques concernés par les changements environnementaux locaux ou globaux.

Rôle du régime de perturbations sur la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes marins

Rôle du régime de perturbations sur la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes marins PDF Author: Annie Séguin
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Chapters 1 and 2 were conducted in situ in marine rock pools and Chapter 3 was carried out in parallel both in marine and freshwater mesocosms. Our first objective was to determine whether an increase in the spatial heterogeneity of a sessile benthic community structure (beta diversity) was diagnostic of disturbed environments (Chapter 1 and 2). We found that the effect of disturbances on spatial heterogeneity was actually much more complex, since the regime (frequency and intensity) associated to the disturbance modulated the response of communities. A disturbance could have opposite effects on spatial heterogeneity, depending on whether it occurs at low or high regimes. The form of the relationship, whether the heterogeneity is increasing, decreasing, linearly or not, depends on the source of the disturbance. The disturbance frequency and intensity also act independently and do not affect the same component of community structure. Disturbance frequency influences species composition, whereas intensity instead affects species cover.

Analyse multi-composantes de la diversité spécifique

Analyse multi-composantes de la diversité spécifique PDF Author: Bastien Merigot
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Languages : en
Pages : 279

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For many years, biodiversity has been of growing interest, in both the lay and the scientific community, with regard to its assessment and preservation. In this context, the present study proposes a methodological framework which explicitly takes into account the multi-component character of diversity with the aim of improving diversity assessment and management. This approach allows to choose only complementary diversity indices that can serve to describe the various facets of the species diversity studied. Our results are important for monitoring the diversity of assemblages as it can serve as a basis for drawing up a preliminary shortlist of indices and thus facilitate the description of these systems. Finally, this approach could allow better assessment of the relative suitability of the various descriptors studied as indicators for monitoring settlements and ecosystems.

Utilisation de la vidéo Haute Définition pour l'étude de la diversité des peuplements ichtyologiques en relation avec la qualité des eaux côtières dans le contexte Méditerranéen

Utilisation de la vidéo Haute Définition pour l'étude de la diversité des peuplements ichtyologiques en relation avec la qualité des eaux côtières dans le contexte Méditerranéen PDF Author: Tania Hernandez Farinas
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Languages : fr
Pages : 43

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Les activités humaines ont aujourd'hui un impact significatif sur les écosystèmes marins et affectent les différentes composantes de la diversité. L'étude des modifications de celle-ci en relation avec les pressions anthropiques constitue l'un des besoins scientifiques nécessaires au développement d'une gestion rationnelle de la diversité biologique. Une récente technique d'observation des assemblages de poissons par vidéo Haute Définition, le système STAVIRO (STations Vidéo ROtatives), a été appliquée en Méditerranée. Cinq zones avec des niveaux de pression différents, dont deux Aires Marines Protégées. ont été échantillonnées avec cette méthode. Plusieurs indices de diversité traditionnels, taxonomiques et fonctionnels ont été calculés. Les résultats montrent une forte dépendance de la diversité avec le type d'habitat. celle-ci étant supérieure dans les zones de récif et d'herbier à Posidonia sur roche. D'autre part, la richesse spécifique, le nombre d'espèces remarquables et l'équitabilité est rencontrée supérieure dans les zones de réserve. Des modèles linéaires généralisés ont été appliqués avec les indices calculés comme variables de réponse pour tester la réponse de celles-ci face aux pressions anthropiques. Les résultats montrent que certains indices permettent de discriminer les niveaux de pression les plus éloignés. Les résultats obtenus montrent que l'utilisation de la vidéo HD est applicable au contexte Méditerranéen, tout en tenant compte de ses limites.

Exploring the Determinants of Community Structure and Functioning

Exploring the Determinants of Community Structure and Functioning PDF Author:
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Les travaux récents sur la relation entre la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes ont souligné certains des aspects les plus dynamiques du fonctionnement des écosystèmes, tout en reconnaissant que la diversité répond à la fois aux variations le long de gradients environnementaux et à la dispersion des espèces entre les communautés locales. Les définitions de la diversité ont été de plus en plus caractérisés en intégrant la notion de traits fonctionnels et ont reconnu la nature flexible de la distribution des traits dans une communauté. Les chapitres de cette thèse se concentrent sur des questions liées à la façon dont la distribution des traits de la communauté est définis, comment ils peuvent informer les écologistes sur les processus associés à l'assemblage de la communauté, comment la composition des communautés pourrait changer sous différentes ampleurs de dispersion, et comment la fonctionnalité pourrait interagir avec la disponibilité des éléments nutritifs pour influencer le fonctionnement global de la communauté. Chaque chapitre va présenter l'un de ces thèmes dans les communautés zoo-et phytoplanctonique, qui emploient des analyses des données déjà recueillies, études de terrain et des expériences contrôlées en mésocosme. Les objectifs de cette thèse spécifiques sont: (1) de comparer les différentes mesures de la diversité (taxonomique et fonctionnelle) dans leur capacité de rendre compte de la biomasse dans les communautés de diatomées benthiques et planctoniques, (2) d'identifier un seuil de dispersion, au-delà duquel différentes communautés de zooplancton pourrait commencer à homogénéiser la composition, (3) de mieux comprendre les communautés de zooplancton naturelles en focusant sur les modèles de distribution dans les traits fonctionnels pour examiner les signes de filtrage ou de de compétition dans l'habitat en tant que facteurs influençant la structure de la communauté, et (4) de vérifier si la diversité fonctionnelle et la disponibilit.

Effets simples et cumulés des perturbations et des stress multiples sur les communautés benthiques intertidales

Effets simples et cumulés des perturbations et des stress multiples sur les communautés benthiques intertidales PDF Author: Stéphanie Cimon
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Les écosystèmes côtiers sont sujets à de nombreux stress et perturbations (stress ci-après) naturels et anthropiques. Ceux-ci agissent sur la stabilité et le fonctionnement des écosystèmes qui peuvent aller jusqu'à une disparition d'habitats et une perte de biodiversité. Bien que ces milieux soient généralement soumis à plusieurs stress à la fois, peu d'études se sont intéressées à la nature et aux conséquences potentielles des effets cumulatifs. Les études mettant l'accent sur de multiples stress sont importantes pour aider à la compréhension des mécanismes qui façonnent les communautés dans un environnement complexe et changeant. L'objectif principal de cette thèse est d'évaluer les effets des stress et leurs interactions sur les communautés macrobenthiques littorales. Pour répondre à cet objectif, mon projet cible le rôle des macrophytes structurants sur leurs communautés associées lorsque des stress affectant les contrôles descendant et/ou ascendant (« top-down » et « bottom-up ») sont présents. Des expériences in situ ont été mises en place dans deux habitats du littoral de l'estuaire maritime du Saint-Laurent : herbiers de zostères et les macroalgues. Le premier chapitre évalue le rôle des macroalgues en milieu médiolittoral rocheux en combinaison avec un enrichissement de la colonne d'eau et une réduction des gastéropodes brouteurs sur la résilience des communautés macrobenthiques associées. Le second chapitre évalue le rôle de la densité des zostères marines en combinaison avec un enrichissement des sédiments et une réduction de la lumière sur l'épifaune associée et les zostères en soi. Le dernier chapitre porte sur les effets de bordure et la densité de zostères marines sur leur épifaune associée sur cinq sites de l'hémisphère Nord (côte ouest de l'Atlantique, côte est du Pacifique, Québec et France) afin de vérifier si les effets de la complexité de l'habitat et du paysage à petite échelle est le même dans des herbiers de zostères pouvant avoir des caractéristiques différentes. Dans chacun des chapitres, des mesures de diversité univariées (richesse, diversité, équitabilité, abondances) et multivariées (structure et composition) au niveau des invertébrés et des algues ont été évaluées. Les types d'interactions entre stresseurs ont aussi été déterminé dans les chapitres 1 et 2 (addition, dominance, synergisme, antagonisme). Des mesures sur la zostère marine ont été ajoutées pour les chapitres 2 et 3 (densité des plants et masse des épibiontes ; chapitre 2 seulement : élongation relative des plants et glucides non-structuraux). Le dernier chapitre utilise une approche par traits biologiques pour comparer des sites qui ont très peu d'espèces communes. Les effets de l'habitat sont ainsi mesurés sur des traits communs à tous les sites. Cette approche permet de faire des rapprochements entre les communautés et leurs fonctions. Les résultats de ma thèse montrent que les espèces structurantes en présence de stress multiples jouent un rôle primordial pour les communautés des habitats côtiers et confirment leurs rôles structurant et protecteur sur les différentes composantes de la biodiversité. Également, les milieux rocheux dominés par les macroalgues et les herbiers de zostères peuvent présenter de la résistance (chapitre II) et sont résilients (chapitres I et II) selon le type de stress temporairement appliqués. Contrairement aux attentes, les parcelles ayant subi les traitements triples n'ont pas été plus affectées que les traitements simples ou doubles à l'exception du traitement triple dans les macroalgues de milieux rocheux (chapitre I) qui a démontré un taux de récupération plus lent que les autres traitements. Ma thèse démontre que lorsque les stress interagissent, les effets ne sont pas systématiquement additifs ou synergiques tels que fréquemment sous-entendus dans la littérature. Plusieurs des interactions mesurées étaient de type dominant, c'est-à-dire que l'effet d'un stress vient éclipser celui d'un second alors qu'en majorité du temps, il n'y a pas eu d'interaction entre stress. Des interactions synergiques négatives, additives et antagonistes ont aussi été observées. Le dernier chapitre montre que l'effet de la complexité des espèces structurantes et l'effet de bordure peuvent être importants ou pas, ainsi ils ne se généralisent pas entre des sites distants, et ce, même en utilisant des traits biologiques. Les résultats suggèrent que la répartition des espèces et les traits biologiques sont influencés par d'autres aspects que seulement l'effet de bordure ou la complexité des zostères, et qu'aucun de ces deux effets ne domine les effets observés sur les assemblages. Ma thèse met en valeur l'importance des expériences in situ qui utilisent des perturbations et des stress multiples pour déterminer leurs effets cumulatifs. Entre autres, la détermination des types d'interaction entre stress est importante au niveau de la gestion des écosystèmes et qu'une simple additivité des stress ne devrait pas être supposée sans tests in situ. Il est primordial que les gestionnaires reconnaissent que les stress pourront avoir des effets locaux spécifiques et que les interactions entre les stress présents sont imprévisibles. Effectivement, les résultats de cette thèse suggèrent que les stress multiples peuvent interagir différemment sur les indices liés à la biodiversité des communautés, leurs structures et leurs fonctions et que leurs interactions ne peuvent pas être prédites en utilisant des mesures sur des stress simples seulement. Effectivement, il sera important pour les gestionnaires d'inclure plusieurs mesures de la diversité, particulièrement des mesures multivariées et des mesures de fonctionnement, dans le but d'évaluer la santé des écosystèmes. Il devient donc prioritaire de maintenir la présence de macrophytes structurants qui soutiennent directement les capacités de résilience et de résistance des communautés face aux stress. Ma thèse permettra une meilleure gestion des écosystèmes en invitant les différents acteurs à porter une attention particulière aux différents indices de biodiversité, aux interactions imprévisibles des stress présents ou prédits, tout en tenant compte de l'unicité dans les caractéristiques et réponses de certains habitats. Coastal ecosystems are exposed to many natural and anthropogenic stress and disturbances (stress afterwards). These stresses affect the stability and functioning of ecosystems and their effect may lead to a loss in biodiversity and habitat. Although coastal systems are exposed to multiple simultaneous stresses, few studies investigated the interaction type and the cumulative effect of stress. Such studies are important for the understanding of how communities are shaped in a complex and changing environment. The main objective of this thesis is to measure the effects of stresses and their interactions on intertidal macrobenthic communities. To reach this goal, this thesis is centered on the role of habitat-forming macrophytes over their associated communities when they are facing stress affecting top-down and bottom-up controls. In situ experiments were performed in two different habitats: eelgrass meadows and rocky intertidal dominated by fucoids. The first chapter evaluates the role of macroalgae in a rocky intertidal system combined to water column enrichment and a reduction of grazing gastropod on the associated macrobenthic community resilience. The second chapter estimates the role of eelgrass shoot density combined to sediment nutrient enrichment and light reduction on associated epifaunal assemblages and eelgrass itself. The last chapter assesses the effect of edge and eelgrass shoot density on associated epifaunal assemblages on five different sites from the northern hemisphere (West Atlantic Coast, East Pacific Coast, Québec and France) to verify if the effects of habitat complexity and small-scale seascape are the same in different eelgrass meadows.

Influence des activités humaines sur les écosystèmes benthiques d'une zone industrialo-portuaire subarctique

Influence des activités humaines sur les écosystèmes benthiques d'une zone industrialo-portuaire subarctique PDF Author: Elliot Dreujou
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« L’ensemble des environnements côtiers et océaniques de la planète est influencé par les activités humaines, dont les impacts peuvent modifier la structure et l’intégrité des écosystèmes de façon durable. Afin de protéger adéquatement le milieu naturel et de soutenir un développement durable, notamment dans des régions concentrant de multiples activités humaines, il est nécessaire de comprendre comment évoluent les écosystèmes marins sous influence anthropique. Les communautés benthiques sont un compartiment particulièrement intéressant pour étudier ces problématiques, car de nombreuses espèces possèdent des capacités d’évitement limitées de par leur mode de vie majoritairement sessile ainsi qu’une longue espérance de vie. Alors que plusieurs travaux évaluant l’impact anthropique ont été effectués sur une large gamme d’écosystèmes à travers le monde, peu ont considéré spécifiquement des écosystèmes subarctiques, dont l’utilisation par l’homme est prévue d’augmenter en lien avec le changement climatique. C’est dans ce contexte que s’inscrit ma thèse, où l’objectif principal est de comprendre comment les écosystèmes benthiques d’une zone industrialo-portuaire subarctique sont influencés par les activités humaines. La zone d’étude considérée se trouve dans la région de Sept-Îles (Québec, Canada), plateforme économique importante pour le Québec, située dans le Golfe du Saint-Laurent. Pour répondre à ces problématiques, cette thèse est divisée en trois chapitres.Le premier chapitre a pour but de caractériser la structure écologique des écosystèmes côtiers considérés. Lors de campagnes de terrain et d’analyses en laboratoire, un total de 289 taxons ont été échantillonnés, dont la majorité, présente dans le Golfe du Saint- Laurent, sont des nouvelles mentions dans cette région. Divers paramètres abiotiques du sédiment ont été évalués, tels que la concentration en matière organique, en métaux lourds et la distribution de fractions granulométriques. L’analyse de la similarité des assemblages d’invertébrés de taille supérieure à 0,5 mm a révélé des signes de perturbation dans certaines zones, avec un nombre accru d’espèces tolérant la pollution et d’espèces opportunistes. Des modèles de régression ont permis de mettre en évidence les variables de l’habitat qui impactent le plus la structure des communautés. Le deuxième chapitre s’intéresse au statut écologique des écosystèmes en se basant sur la composition des communautés benthiques. Seize indicateurs du statut écologique ont été sélectionnés au moyen d’une revue de littérature, puis divisés en trois catégories selon leur méthodologie : mesures d’abondance, diversité des communautés et espèces indicatrices. Ces indicateurs ont été appliqués en utilisant les listes d’espèces obtenues lors du chapitre précédent, et la majorité a détecté des communautés diversifiées sans signe évident de perturbation. De plus, plusieurs corrélations significatives ont été détectées entre les indicateurs et les paramètres de l’habitat, notamment avec les concentrations en métaux lourds. Chaque catégorie d’indicateur apporte des informations importantes sur l’état de l’écosystème tout en présentant des limitations, en particulier à propos des références utilisées pour définir le statut écologique.Le dernier chapitre a pris en compte les activités humaines influençant l’écosystème, afin de calculer une empreinte anthropique locale sur les communautés selon des gradients d’exposition. Un indice d’exposition pour chaque activité considérée (aquaculture, dragage, influence industrielle, influence municipale, pêcheries, rejets d’égouts, transport maritime) a été développé grâce à la distance depuis leur(s) source(s) et des données de pêche. Plusieurs liens ont été découverts entre les indices d’expositions obtenus et la distribution des invertébrés benthiques, au moyen de modèles prédictifs Hierarchical Modelling of Species Communities. L’indice d’exposition cumulée a mis en évidence des zones de superposition d’activité humaine. Le profil des communautés présentes dans ces régions n’est pas particulièrement perturbé, ce qui corrobore les résultats des chapitres précédents sur le statut des écosystèmes considérés. Cette thèse de doctorat contribue à l’amélioration des connaissances sur les écosystèmes côtiers subarctiques, notamment en présentant la première étude de biodiversité benthique dans la région de Sept-Îles. Des méthodes d’évaluation du statut écologique et de l’exposition anthropique ont été développées à l’échelle locale (

Répercussions actuelles et futures du changement climatique sur les communautés benthiques dans l'Arctique Canadien

Répercussions actuelles et futures du changement climatique sur les communautés benthiques dans l'Arctique Canadien PDF Author: Marie Pierrejean
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Pages : 167

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L’océan Arctique est une des régions les plus touchées par les changements climatiques. Une importante augmentation de la température de ses eaux de surfaces et des précipitations y est attendue, entrainant une perte significative du couvert de glace et une augmentation des activités humaines. Causant des effets sur les paramètres physico-chimiques, ces changements devraient directement affecter les producteurs primaires (algues de glace et phytoplancton), et de ce fait limiter l’apport de matière organique vers les fonds marins. Il est ainsi admis que les changements climatiques affecteraient la distribution, la diversité et l’abondance des communautés benthiques, en raison de leur impact sur les paramètres environnementaux (couplage pélago-benthique et paramètres physico-chimiques), mais également sur les services et fonctions écosystémiques (par exemple la reminéralisation benthique). La diminution de l’étendue et de l’épaisseur de la glace de mer, la désalinisation des eaux de surface ou bien encore l’augmentation du trafic maritime dans les régions de la Baie d’Hudson et de l’est de l’Arctique Canadien, sont susceptibles d’être à l’origine de grands changements dans la structure des communautés benthiques et des habitats à structures biogéniques. Les impacts des changements climatiques sur les écosystèmes benthiques arctiques étant jusqu’alors peu connus, les objectifs de cette thèse étaient de i) d’apporter une description plus complète et actualisée de la diversité et la distribution spatiale des communautés benthiques dans le complexe de la Baie d’Hudson ; ii) de comprendre les effets des changements climatiques sur la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes benthiques; et iii) d’enrichir les connaissances des écosystèmes benthiques et d’appuyer la désignation de zones d’intérêt écologique et biologique ainsi que des aires marines protégées. Les travaux réalisés pendant cette thèse nous ont permis de i) mettre à jour les données épibenthiques dans le complexe de la Baie d’Hudson ; ii) aider les gestionnaires dans la mise en place de zones d’importance écologique et biologique ainsi que de zones d’intérêts pour une future désignation d’aires marines protégées; et iii) mettre en évidence l’importance des coraux de bambous en milieu profond sur le fonctionnement de l’écosystème benthique. Un total de 380 taxa a été dénombré dans 46 stations à travers le complexe de la Baie d’Hudson. Malgré une relativement faible couverture spatiale de notre échantillonnage, nous avons été en mesure d’estimer que ce recensement représentait 71 % des taxons présents dans le complexe de la Baie d’Hudson. Nous avons montré que la biomasse, l’abondance, la diversité ainsi que la distribution spatiale des communautés épibenthiques étaient fortement influencées par le substrat, la salinité, les ressources alimentaires et la couverture de glace. Nous avons aussi pu démontrer que la faible diversité, abondance et biomasse des communautés observées près des côtes étaient causées par les importants écoulements d’eaux douces. À l’inverse, les données récoltées dans les polynies situées plus au large montrent un fort couplage pélago-benthique se traduisant par une forte productivité en termes de biomasse, d’abondance et de diversité. L’utilisation d’un modèle de distribution des communautés a permis de démontrer l’importance de la présence de glace et indirectement des algues de glace associées à cet habitat sur les communautés épibenthiques occupant le centre de la Baie d’Hudson. La projection des communautés sous un scénario climatique RCP4.5 a révélé que le centre de la Baie ressortait, potentiellement, comme étant la zone la plus vulnérable aux changements climatiques puisqu’une perte de diversité liée à la diminution de la glace de mer est attendue. À l’inverse, les zones côtières pourraient possiblement servir de refuges en augmentant la diversité. En outre, notre étude a montré que la présence des structures biogéniques telles que les coraux bambous, dans les habitats profonds, améliore le piégeage des particules de matière organique menant à une plus forte densité d’espèces endofauniques dans ces milieux comparativement à des sédiments nus. Cet effet a également été constaté dans la reminéralisation benthique où les sédiments des structures biogéniques agissaient comme source de nitrates et d’ammonium. En revanche, nos travaux n’ont pu démontrer ces effets dans un habitat moins profond hébergeant des éponges. En générant de nouvelles connaissances sur la répartition actuelle et future des communautés épibenthiques du complexe de la Baie d’Hudson ainsi que sur le fonctionnement de l’écosystème benthique dans les habitats à structures biogéniques, les résultats de cette thèse contribueront à désigner des zones d’importance écologique et biologique ainsi qu’à la mise en place d’aires marines protégées et de stratégies de conservation de la biodiversité arctique.

Relation " communauté-ressource "

Relation Author: Sandrine Fanfard
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Dérivants ou submergés, les débris grossiers dérivés de plantes terrestres fournissent de l'énergie et des nutriments pour les écosystèmes marins. En considérant cette matière organique allochtone, l'objectif de ma thèse est de décrire le processus d'assemblage d'une communauté autour d'une ressource trophique et de considérer en retour l'effet de la diversité et de la composition observée au sein de cette communauté sur la dynamique d'exploitation de la ressource. Pour ce faire, j'ai combiné des expériences in situ et la modélisation avec l'intention de parvenir à une description cohérente et quantitative du lien écogéochimique entre la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes. En utilisant de la litière de feuilles et du bois mort, cette approche a permis: (i) de montrer l'importance des interactions biotiques dès le début du processus d'assemblage de la communauté, (ii) de faire le lien explicite entre la consommation des ressources et la dynamique de populations des consommateurs, et (iii) de tester comment la transformation des ressources est affectée par la diversité observée au sein des communautés.