Interactions faibles protéine-protéine en solution PDF Download
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Author: Lionel Costenaro
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 221
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Book Description
La cellule est un milieu très concentré où les interactions entre macromolécules, même faibles, jouent un grand rôle dans leur solubilité et dans l'assemblage des complexes labiles assurant les fonctions biologiques. Les interactions faibles entre protéines déterminant la non-idéalité de leurs solutions vont aussi gouverner leur cristallisation. Dans quelle mesure les interactions protéine - solvant influencent-elles les interactions protéine - protéine ? Nous avons mis en relation ces deux types d'interactions pour la malate déshydrogénase (Hm MalDH) de Haloarcula marismortui, protéine halophile très acide qui a des solvatations variées et très riches en eau et en sel. Nous avons développé une nouvelle méthode de détermination du second coefficient du viriel A2 par la modélisation des profils de vitesse de sédimentation en ultracentrifugation analytique, qui permet l'étude de solvants complexes. Les interactions protéine - protéine de la Hm MalDH en divers sels ont été caractérisées par diffusion de neutrons ou de rayons X aux petits angles. Les A2 et les facteurs de structure en solution ont été modélisés par des potentiels d'interaction de type DLVO. Les interactions répulsives sont principalement dues au terme de volume exclu et dans une moindre mesure au terme électrostatique. Les interactions attractives sont qualitativement corrélées à des valeurs positives ou négatives des paramètres d'interaction préférentielle avec le sel. Ces résultats permettent d'expliquer l'adaptation moléculaire des protéines halophiles qui doivent ainsi avoir une solvatation riche en sel pour rester soluble à haut sel. La cristallisation par dilution de la Hm MalDH dans des mélanges sel - MPD (méthyl-2-pentanediol-2,4) résulte d'une lente évolution des interactions protéine - protéine, de répulsives à modérément attractives. Le MPD modifie les interactions protéine - protéine en divers sels en ajoutant une attraction qui est liée à la répulsion du MPD par les charges de la protéine.
Author: Lionel Costenaro
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 221
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Book Description
La cellule est un milieu très concentré où les interactions entre macromolécules, même faibles, jouent un grand rôle dans leur solubilité et dans l'assemblage des complexes labiles assurant les fonctions biologiques. Les interactions faibles entre protéines déterminant la non-idéalité de leurs solutions vont aussi gouverner leur cristallisation. Dans quelle mesure les interactions protéine - solvant influencent-elles les interactions protéine - protéine ? Nous avons mis en relation ces deux types d'interactions pour la malate déshydrogénase (Hm MalDH) de Haloarcula marismortui, protéine halophile très acide qui a des solvatations variées et très riches en eau et en sel. Nous avons développé une nouvelle méthode de détermination du second coefficient du viriel A2 par la modélisation des profils de vitesse de sédimentation en ultracentrifugation analytique, qui permet l'étude de solvants complexes. Les interactions protéine - protéine de la Hm MalDH en divers sels ont été caractérisées par diffusion de neutrons ou de rayons X aux petits angles. Les A2 et les facteurs de structure en solution ont été modélisés par des potentiels d'interaction de type DLVO. Les interactions répulsives sont principalement dues au terme de volume exclu et dans une moindre mesure au terme électrostatique. Les interactions attractives sont qualitativement corrélées à des valeurs positives ou négatives des paramètres d'interaction préférentielle avec le sel. Ces résultats permettent d'expliquer l'adaptation moléculaire des protéines halophiles qui doivent ainsi avoir une solvatation riche en sel pour rester soluble à haut sel. La cristallisation par dilution de la Hm MalDH dans des mélanges sel - MPD (méthyl-2-pentanediol-2,4) résulte d'une lente évolution des interactions protéine - protéine, de répulsives à modérément attractives. Le MPD modifie les interactions protéine - protéine en divers sels en ajoutant une attraction qui est liée à la répulsion du MPD par les charges de la protéine.
Author: Lionel Costenaro
Publisher: Omniscriptum
ISBN: 9786131506048
Category :
Languages : fr
Pages : 208
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Book Description
La cellule est un milieu très concentré où les interactions entre macromolécules, mème faibles, sont cruciales pour leur solubilité et leur fonction biologique. Dans quelle mesure la solvatation d'une protéine influence-t-elle ses interactions faibles protéine - protéine, qui déterminent sa solubilité? Nous avons relié ces interactions à la solvatation de la malate déshydrogénase de Haloarcula marismortui, une protéine halophile dont la solvatation dépend fortement du solvant. Les interactions protéine - protéine dans divers solvants ont été caractérisées en mesurant les seconds coefficients du viriel (A2) et en modélisant par des potentiels de type DLVO les facteurs de structure en solution obtenus par la diffusion de rayons X ou de neutrons. Nous avons aussi développé une nouvelle méthode de mesure de A2 par vitesse de sédimentation. Nous montrons qu'une solvatation enrichie en eau ou en sel induit des interactions attractives substantielles qui peuvent conduire à la cristallisation des protéines. Ces résultats expliquent l'adaptation moléculaire aux fortes salinités des protéines halophiles en termes de stabilité, mais aussi -de manière originale- en termes de solubilité.
Author: Andrey Karshikoff
Publisher: World Scientific
ISBN: 9811228108
Category : Science
Languages : en
Pages : 445
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Book Description
Although textbooks on the physics of condensed matter consider non-covalent interactions in detail, their application for analysis of protein properties is often poorly presented or omitted. On the other hand, books on biochemistry, molecular modeling or molecular simulation introduce these interactions in the context of the corresponding topic, which sometimes results in superficial explanations of their nature. This book succeeds in uniting comprehensive considerations of non-covalent interactions with the specificity of their application in protein sciences.This second edition includes new chapters on intrinsically disordered proteins, microcalorimetry of proteins, cold denaturation, thermodynamic stability and thermal adaptability of proteins. The ideal aid for students of physics or chemistry, with interests in biology and biophysics, the book can also be useful for students of biology, biochemistry, or biomedicine who want to extend their knowledge of how protein properties are described at the molecular level.
Author: Sylvaine Lafont
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 150
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LE TRAVAIL PRESENTE DANS CETTE THESE CONCERNE LA CRISTALLISATION DES PROTEINES. NOTRE OBJECTIF EST D'APPORTER UNE CONTRIBUTION A LA COMPREHENSION DES MECANISMES DE CROISSANCE ET DE CONTROLER LA CRISTALLISATION DE CES MACROMOLECULES BIOLOGIQUES. NOUS AVONS ETUDIE TROIS SYSTEMES DE NATURE ET DE POIDS MOLECULAIRE DISTINCTS: L'AMYLASE PANCREATIQUE DE PORC, L'INHIBITEUR DE LA TRYPSINE PANCREATIQUE DE BUF ET, LA PARVALBUMINE DE BROCHET. CES PROTEINES CRISTALLISENT SOUS DES CONDITIONS TRES DIFFERENTES ET REPRESENTENT DES MODELES POUR LA COMPREHENSION DES MECANISMES DE CRISTALLISATION. DANS CHAQUE CAS, NOUS AVONS DETERMINE LES DIAGRAMMES DE PHASE EN FONCTION DE LA TEMPERATURE, DE LA CONCENTRATION ET DE LA NATURE DE L'AGENT DE CRISTALLISATION. LA CONNAISSANCE DES DIAGRAMMES DE PHASE PERMET D'ETUDIER LES CINETIQUES DE CROISSANCE EN FONCTION DE LA SURSATURATION. PUIS, NOUS AVONS CARACTERISE LES SOLUTIONS DE PROTEINE EN FONCTION DE DIFFERENTS PARAMETRES PHYSICO-CHIMIQUES. LES METHODES DE DIFFUSION DE LA LUMIERE ET DES RAYONS X AUX PETITS ANGLES ET L'OSMOMETRIE (MESURE DE LA PRESSION OSMOTIQUE) PERMETTENT DE DETERMINER IN SITU LA NATURE DES INTERACTIONS ENTRE MOLECULES DE PROTEINES, ET LEUR DEGRE D'ASSOCIATION EN SOLUTIONS SOUS- ET SURSATUREES. CETTE APPROCHE DE LA CRISTALLOGENESE DES PROTEINES PAR LES ETUDES DE SOLUBILITE ET DE CINETIQUES DE CROISSANCE D'UNE PART ET PAR LA CARACTERISATION DES MOLECULES EN SOLUTION D'AUTRE PART, A PERMIS DE MONTRER LA CORRELATION EXISTANT ENTRE CONDITIONS DE CRISTALLISATION, VITESSES DE CROISSANCE ET APPARITION DES INTERACTIONS PROTEINE-PROTEINE ATTRACTIVES
Author: Wei Liu
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : en
Pages : 310
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Author: Dilipkumar N. Asthagiri
Publisher:
ISBN:
Category : Proteins
Languages : en
Pages : 400
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Author:
Publisher:
ISBN:
Category : Physics
Languages : en
Pages : 680
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Author:
Publisher:
ISBN:
Category : Analytical chemistry
Languages : en
Pages : 1098
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Author: Institut national de la santé et de la recherche médicale (France)
Publisher:
ISBN:
Category : Blood platelets
Languages : en
Pages : 348
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Author: Maria Hayes
Publisher: John Wiley & Sons
ISBN: 111938530X
Category : Science
Languages : en
Pages : 352
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A groundbreaking text that highlights the various sources, applications and advancements concerning proteins from novel and traditional sources Novel Proteins for Food, Pharmaceuticals and Agriculture offers a guide to the various sources, applications, and advancements that exist and are currently being researched concerning proteins from novel and traditional sources. The contributors—noted experts in the field—discuss sustainable protein resources and include illustrative examples of bioactive compounds isolated from several resources that have or could obtain high market value in specific markets. The text also explores a wide range of topics such as functional food formulations and pharmaceutical applications, and how they alter biological activity to provide therapeutic benefits, nutritional values and health protection. The authors also examine the techno-functional applications of proteins and looks at the screening process for identification of bioactive molecules derived from protein sources. In addition, the text provides insight into the market opportunities that exist for novel proteins such as insect, by-product derived, macroalgal and others. The authors also discuss the identification and commercialization of new proteins for various markets. This vital text: Puts the focus on the various sources, applications and advancements concerning proteins from novel and traditional sources Contains a discussion on how processing technologies currently applied to dairy could be applied to novel protein sources such as insect and macroalgal Reviews the sustainability of protein sources and restrictions that exist concerning development Offers ideas for creating an innovative and enterprising economy that is built on recent developments Details the potential to exploit key market opportunities in sports, infant and elderly nutrition and techno-functional protein applications Written for industrial researchers as well as PhD and Post-doctoral researchers, and undergraduate students studying biochemistry, food engineering and biological sciences and those interested in market developments, Novel Proteins for Food, Pharmaceuticals and Agriculture offers an essential guide to the sources, applications and most recent developments of the proteins from both innovative and traditional sources.
