Etude RMN structurale et fonctionnelle de macromolécules biologiques impliquées dans des modulations de pathogénicité bactérienne et virale PDF Download
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Author: Julien Boudet
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 249
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Book Description
Au niveau cellulaire, une communication continue et régulée doit être maintenue entre les centres de contrôles internes (en charge de la production et de la gestion des macromolécules biologiques) et les récepteurs périphériques (extra ou intracellulaires) initiateurs moléculaires de la réponse. Cette opération a pour but de préserver l'intégrité de tout organisme vivant. Le décryptage moléculaire des différentes étapes requises pour expliquer les systèmes complexes d'interactions (transduction du signal) nécessite de disposer de méthodes biophysiques puissantes, susceptibles de fournir des informations pertinentes pour la construction de modèles physiologiques ou pathologiques intégrés. Ainsi, trois méthodes biophysiques complémentaires (calorimétrie de titration isotherme, résonance magnétique nucléaire et fluorescence) ont été analysées en terme de stratégies d'investigation et de limites de validité. Par la suite, deux sujets liés à des modulations de pathogénicité bactérienne et virale ont été abordés. Dans une première phase, le phénomène de résistance de souches bactériennes aux molécules antibiotiques a été abordé selon deux angles différents. Tout d'abord, plusieurs expériences RMN ont été effectuées afin d'améliorer le niveau de connaissance actuel concernant les détails moléculaires de la transduction du signal requise pour la destruction des antibiotiques de type beta-lactames. Plus particulièrement la levée de répression du gène codant pour la beta-lactamase a été étudiée. Dans une seconde approche, de nouvelles cibles protéiques ont été recherchées et la structure en solution d'une nouvelle protéine a été résolue. Les résultats obtenus et les modèles déduits sont exposés dans ce manuscrit. Pour terminer, une étude combinant génie génétique, RMN, cristallographie et fluorescence in vivo a ouvert une brèche, à l'échelle atomique, vers la compréhension intégrée du phénomène de transmissibilité inter-espèce du virus influenza (notamment grâce à l'obtention de la première structure haute-résolution du ITagment C-terminal de la sous-unité PB2 de la polymérase virale d'irifluenza).
Author: Julien Boudet
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 249
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Book Description
Au niveau cellulaire, une communication continue et régulée doit être maintenue entre les centres de contrôles internes (en charge de la production et de la gestion des macromolécules biologiques) et les récepteurs périphériques (extra ou intracellulaires) initiateurs moléculaires de la réponse. Cette opération a pour but de préserver l'intégrité de tout organisme vivant. Le décryptage moléculaire des différentes étapes requises pour expliquer les systèmes complexes d'interactions (transduction du signal) nécessite de disposer de méthodes biophysiques puissantes, susceptibles de fournir des informations pertinentes pour la construction de modèles physiologiques ou pathologiques intégrés. Ainsi, trois méthodes biophysiques complémentaires (calorimétrie de titration isotherme, résonance magnétique nucléaire et fluorescence) ont été analysées en terme de stratégies d'investigation et de limites de validité. Par la suite, deux sujets liés à des modulations de pathogénicité bactérienne et virale ont été abordés. Dans une première phase, le phénomène de résistance de souches bactériennes aux molécules antibiotiques a été abordé selon deux angles différents. Tout d'abord, plusieurs expériences RMN ont été effectuées afin d'améliorer le niveau de connaissance actuel concernant les détails moléculaires de la transduction du signal requise pour la destruction des antibiotiques de type beta-lactames. Plus particulièrement la levée de répression du gène codant pour la beta-lactamase a été étudiée. Dans une seconde approche, de nouvelles cibles protéiques ont été recherchées et la structure en solution d'une nouvelle protéine a été résolue. Les résultats obtenus et les modèles déduits sont exposés dans ce manuscrit. Pour terminer, une étude combinant génie génétique, RMN, cristallographie et fluorescence in vivo a ouvert une brèche, à l'échelle atomique, vers la compréhension intégrée du phénomène de transmissibilité inter-espèce du virus influenza (notamment grâce à l'obtention de la première structure haute-résolution du ITagment C-terminal de la sous-unité PB2 de la polymérase virale d'irifluenza).
Author: Pierre-Jean Matteï
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 280
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Book Description
La première partie de cette thèse s'intéresse au complexe PBP2 :MreC impliqué dans l'élongation d' Helicobacter pylori, pathogène responsable de pathologies gastriques. Ce complexe a pu être mis en évidence in vitro dont nous avons déterminé la stoechiométrie par différentes méthodes. Ce complexe 1 : 1 a été analysé par diffusion des rayons X aux petits angles permettant de modéliser une enveloppe du complexe à basse résolution. Des cristaux du complexe ont été obtenus ainsi qu'un jeu de données à 2.7 A. Par remplacement moléculaire, un domaine très conservé des PBP a pu être placé mais la présence de MreC est encore discutable. La seconde partie s'intéresse au système de sécrétion de type III, facteur de virulence majeur chez Pseudomonas a eruginosa , bactérie causant des maladies nosocomiales. PopB et PopD, deux protéines membranaires, forment un pore au niveau de la membrane d'une cellule-cible, nécessaire à la translocation de toxines. PopB a été purifiée sous forme soluble en présence de sa chaperonne, PcrH, complexe dissociable en présence de détergents et lipides. PopB seule, serait capable d'oligomériser en hexamère en formant des structures annulaires. La topologie du pore a également été déterminée dans des liposomes montrant ainsi que Po pB est insérée dans la membrane alors que PopD n'est associée que superficiellement. Pour finir, la structure de PcrH, a été résolue avec un peptide de PopD. Les résidus de Pc rH intervenant dans ce complexe sont essentiels à la sécrétion de PopD et à la formation du pore de translocation. Nous cherchons actuellement de petites molécules qui seraient capables d'interagir avec Pc rH et empêcheraient son interaction avec PopB et PopD.
Author: Ursula Jakob
Publisher: Springer Science & Business Media
ISBN: 9400757875
Category : Science
Languages : en
Pages : 488
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Book Description
Many physiological conditions such as host defense or aging and pathological conditions such as neurodegenerative diseases, and diabetes are associated with the accumulation of high levels of reactive oxygen species and reactive nitrogen species. This generates a condition called oxidative stress. Low levels of reactive oxygen species, however, which are continuously produced during aerobic metabolism, function as important signaling molecules, setting the metabolic pace of cells and regulating processes ranging from gene expression to apoptosis. For this book we would like to recruit the experts in the field of redox chemistry, bioinformatics and proteomics, redox signaling and oxidative stress biology to discuss how organisms achieve the appropriate redox balance, the mechanisms that lead to oxidative stress conditions and the physiological consequences that contribute to aging and disease.
Author: Mark S. Meskin
Publisher: CRC Press
ISBN: 1420031694
Category : Medical
Languages : en
Pages : 221
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Book Description
Are soy isoflavones neuroprotective? Just how different is one species of Echinacea from another? Which phytochemicals will be effective as therapeutic agents in vivo? Supported by solid scientific research, Phytochemicals in Nutrition and Health helps provide answers to these and other probing questions concerning the mechanisms of action associat
Author: Joginder Singh
Publisher: Springer Nature
ISBN: 9811528179
Category : Science
Languages : en
Pages : 377
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Book Description
Microbial biotechnology is an important area that promotes advanced research into using microbes for value-added products, human nutrition, and the overall wellbeing of society. This book presents the latest information on the use of microbes for sustainable development, and highlights state-of-the-art biotechnological techniques used to harness microbial biotechnological traits on a commercial scale. Gathering contributions from authoritative researchers in the field, it addresses recent advances in microbial biotechnological approaches that offer sustainable options for future generations. Exploring a broad range of microbial products and their uses, the book specifically places emphasis on the application of microorganisms in healthcare, the environment and industry. It also discusses various compound classes derived from microbial metabolites. Pursuing a holistic approach to recent advances in the utilization of various microbes as biotechnological tools, the book also covers traditional uses, and explores emerging strategies to harness their full potential. Accordingly, it offers a valuable resource for researchers and graduate students alike.
