Détection des virus entériques infectieux dans le milieu hydrique PDF Download
Are you looking for read ebook online? Search for your book and save it on your Kindle device, PC, phones or tablets. Download Détection des virus entériques infectieux dans le milieu hydrique PDF full book. Access full book title Détection des virus entériques infectieux dans le milieu hydrique by Camille Bach. Download full books in PDF and EPUB format.
Author: Camille Bach
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 0
Get Book Here
Book Description
Les virus entériques abondent dans le milieu hydrique et sont responsables de gastro-entérites aigües, d'hépatites, mais aussi d'autres pathologies comme la poliomyélite. La contamination de l'homme par des virus entériques pathogènes peut notamment être due à la consommation d'eau ou d'aliments contaminés. A l'heure actuelle, la détermination de la qualité microbiologique des eaux destinées à la consommation est uniquement basée sur des indicateurs bactériens qui ne permettent pas une évaluation satisfaisante du danger viral. Si la culture cellulaire permet de connaitre le statut infectieux des virus détectés, elle n'est pas applicable à tous les virus entériques. Ainsi, les norovirus qui sont des virus entériquesfortement impliqués dans les cas de gastro-entérites ne sont pas cultivables. Les techniques de biologie moléculaire comme la RT-PCR permettent quant à elles une détection rapide et spécifique du génome viral. Cependant plusieurs études ont montré que le génome viral ne peut être utilisé comme marqueur de la présence de virus infectieux dans l'environnement. Devant ce constat, il apparait nécessaire de développer de nouvelles méthodes de détection. Si les méthodes couplant la culture cellulaire à une détection par biologie moléculaire fournissent des résultats rapides et permettent de conclure sur l'infectiosité du virus, elles ne résolvent pas le problème lié à la nécessité de disposer d'une lignée cellulaire permissive du virus recherché. D'autres études se sont intéressées à l'intégrité de la capside virale ou du génome de façon indépendante. Cependant, le fait de ne pas prendre en compte la totalité de la particule virale ne permet pas, avec les méthodes actuelles, d'évaluer son infectiosité. Pour le développement de nouvelles méthodes de détection des particules virales infectieuses, des pistes pourraient être explorées concernant les modifications des interactions entre la capside et le génome lors de l'inactivation virale.
Author: Camille Bach
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 0
Get Book Here
Book Description
Les virus entériques abondent dans le milieu hydrique et sont responsables de gastro-entérites aigües, d'hépatites, mais aussi d'autres pathologies comme la poliomyélite. La contamination de l'homme par des virus entériques pathogènes peut notamment être due à la consommation d'eau ou d'aliments contaminés. A l'heure actuelle, la détermination de la qualité microbiologique des eaux destinées à la consommation est uniquement basée sur des indicateurs bactériens qui ne permettent pas une évaluation satisfaisante du danger viral. Si la culture cellulaire permet de connaitre le statut infectieux des virus détectés, elle n'est pas applicable à tous les virus entériques. Ainsi, les norovirus qui sont des virus entériquesfortement impliqués dans les cas de gastro-entérites ne sont pas cultivables. Les techniques de biologie moléculaire comme la RT-PCR permettent quant à elles une détection rapide et spécifique du génome viral. Cependant plusieurs études ont montré que le génome viral ne peut être utilisé comme marqueur de la présence de virus infectieux dans l'environnement. Devant ce constat, il apparait nécessaire de développer de nouvelles méthodes de détection. Si les méthodes couplant la culture cellulaire à une détection par biologie moléculaire fournissent des résultats rapides et permettent de conclure sur l'infectiosité du virus, elles ne résolvent pas le problème lié à la nécessité de disposer d'une lignée cellulaire permissive du virus recherché. D'autres études se sont intéressées à l'intégrité de la capside virale ou du génome de façon indépendante. Cependant, le fait de ne pas prendre en compte la totalité de la particule virale ne permet pas, avec les méthodes actuelles, d'évaluer son infectiosité. Pour le développement de nouvelles méthodes de détection des particules virales infectieuses, des pistes pourraient être explorées concernant les modifications des interactions entre la capside et le génome lors de l'inactivation virale.
Author: Chantal Jehl-Pietri
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages :
Get Book Here
Book Description
Author: Samira Senouci
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages :
Get Book Here
Book Description
Thèse de doctorat en chime et microbiologie de l'eau. La recherche des Enterovirus dans le milieu hydrique pose encore de nombreux problèmes techniques notamment en ce qui concerne la concentration des virus dans des échantillons de nature différente. S'il est admis que dans les eaux usées urbaines, la concentration en virus peut être suffisamment importante pour permettre leur détection directe, en revanche, dans tous les autres types d'eaux, elle est la plupart du temps faible et il devient très difficile de réaliser une détection directe. Il est alors indispensable de procéder systématiquement à une concentration sous un faible volume des particules virales présentes dans un grand volume d'eau à analyser. En tenant compte de ces données, il est important de disposer de méthodologies appropriées permettant la détection des virus entériques dans le milieu hydrique. Notre travail comporte deux objectifs essentiels. Le premier objectif de notre travail est essentiellement technique. Il est fondé sur le fait que les virus entériques sont présents, en général, en faible quantité dans le milieu hydrique. Il est donc nécessaire, la plupart du temps, de les concentrer sous un faible volume avant de pouvoir ensuite les détecter. Dans ces conditions, la valeur d'une analyse virologique d'une eau dépend d'abord de la qualité virologique des techniques de concentration utilisées. Notre objectif est d'évaluer des techniques de concentration primaire et secondaire des Enterovirus. Trois méthodologies de concentration primaire fondées sur l'adsorption-élution sur verre (poudre de verre et laine de verre) et deux techniques de concentration secondaire fondées sur la précipitation (précipitation organique et précipitation au polyéthylène glycol 6000) seront testées comparativement sur différents types d'eau artificiellement ou naturellement contaminés, de façon à tenter de déterminer les protocoles présentant le meilleur rendement et la plus grande efficacité pour l'isolement des virus infectieux et de leur génome. Le deuxième objectif est de déterminer le niveau de contamination microbienne et en particulier virologique du milieu hydrique au Maroc. Pour ce faire, nous rechercherons des Enterovirus et des bactéries pathogènes (Salmonelles, vibrions, ... ) dans différents types d'eaux (eaux usées , eaux d'estuaire, eaux de mer, eaux de puits). Mais, nous isolerons et quantifierons aussi les indicateurs bactériens et viraux (coliphages somatiques). Celte recherche simultanée des pathogènes et des indicateurs devrait permettre de tenter d'établir des corrélations et d'identifier les indicateurs les plus représentatifs de chaque catégorie de pathogène.
Author: Benoit Prevost
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 0
Get Book Here
Book Description
Les virus entériques sont l'une des principales causes d'épidémies de gastroentérites chez l'Homme. Ces virus sont essentiellement excrétés dans les selles et sont donc observés en grande quantité au sein des eaux usées. L'abattement viral est très variable en fonction des types de traitements mis en place dans les stations d'épurations (STEP). Malgré ces traitements, la grande majorité des STEP rejettent d'importantes quantités de virus entériques dans l'environnement. L'objectif de ce travail a été d'apporter des éléments de réponse concernant la circulation des virus entériques humains dans un environnement hydrique urbain. Pour cela, des méthodes d'analyse ont été mises au point afin de permettre la détection d'un large panel de virus entériques dans différentes matrices hydriques susceptibles d'être étudiées dans l'environnement. Trois contrôles ont été développés afin de vérifier le bon déroulement de cette méthode et donc de valider les résultats obtenus. Une campagne d'échantillonnage a été réalisée au niveau d'un tronçon de la Seine impacté par les affluents naturels et des effluents de STEP. La prise en compte des débits au niveau des différents points de prélèvement a permis de calculer les flux viraux qui correspondent à la quantité de virus circulant en un point au cours d'une unité de temps. Cette approche a permis de démontrer la contribution majeure des effluents de STEP dans la contamination virale du milieu récepteur. Parmi l'ensemble des virus entériques recherchés, les adénovirus, les norovirus, les astrovirus et les rotavirus présentaient les charges virales les plus importantes dans les effluents de STEP et dans les eaux de surface. Leurs quantités au sein de ces matrices d'eau étaient les plus importantes durant la période hivernale ce qui était cohérent avec les données épidémiologiques. Un lien étroit entre l'état sanitaire de la population humaine reliée au réseau d'assainissement et la concentration en virus entériques des effluents de STEP et des eaux de surface a pu être établi. Sur ces mêmes prélèvements, l'étude de la diversité des astrovirus et des norovirus de génogroupes I et II a été réalisée par pyroséquençage. Cette approche a permis d'établir un profil des différents génotypes circulant dans les effluents de STEP. Au regard des données épidémiologiques recueillies sur la même période par le Centre National de Référence des virus entériques, un grand nombre de génotypes communs ont pu être observés entre ces deux jeux de données. Ce constat met en évidence le caractère informatif de l'analyse des effluents de STEP qui fournit un profil relativement pertinent des virus entériques circulant dans l'environnement mais aussi dans la population humaine. La présence de virus entériques présente dans les eaux de surface, ressources utilisées pour la potabilisation, est un réel problème de santé publique. C'est pourquoi la dernière partie de ce travail s'intéresse à évaluer leur persistance dans l'eau de surface et l'eau destinée à la consommation humaine, mais aussi face à des traitements de désinfection, fréquemment utilisés dans les usines de potabilisation et parfois en sortie de STEP. L'absence de modèle cellulaire pour la plupart de ces virus nous a conduit à développer une approche basée sur l'emploi d'agents intercalants permettant d'évaluer l'intégrité de la capside des particules virales détectées par PCR en temps réel. L'utilisation de ces agents intercalants s'est avérée pertinente à partir du moment où les conditions conduisent à une dégradation des capsides virales. Par conséquent, leur emploi sur des échantillons d'eau potabilisée a permis une meilleure estimation du risque sanitaire associé à la consommation de l'eau produite. En conclusion, ce travail propose des méthodes d'analyse qui ont permis de mettre en exergue les relations existantes entre la circulation des virus entériques dans l'environnement et l'état sanitaire de la population humaine.
Author: Amira Arraj
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 198
Get Book Here
Book Description
Nous avons comparé le comportement de phages phiX174 et MS2 et celui de poliovirus, hépatite A et rotavirus SA11 dans un pilote de laboratoire à boues activées. Les résultats montrent que dès l'injection, il y a une réduction virale immédiate dans la phase liquide variable selon le virus. Cette régression, pourrait être expliquée par une adsorption virale instatanée aux matières solides. Le titre viral, dans la phase liquide, est ensuite réduit plus lentement par rapport à la quantité détectée à 10 min pour se stabiliser 3 jours après injection. Le SA11 n'a pas été détecté dans la phase solide. Nous avons recherché la présence et la fréquence saisonnière de virus entériques dans la station d'épuration de Clermont-Ferrand (2002-2003). La recherche des virus entériques dans les eaux usées a été effectuée par RT-PCR. Après séquençage, une analyse phylogénétique a permis de comparer les différentes souches. Rotavirus A et astrovirus ont été identifiés dans 24,1% et 29,3% des échantillons testés. Les eaux épurées étaient plus fréquement positives que les effluents d'entrées. Certaines souches de rotavirus isolées étaient identiques à des souches isolées de patients malades.
Author: Daniel Garin
Publisher:
ISBN:
Category :
Languages : en
Pages : 166
Get Book Here
Book Description
L'HOMME MALADE OU PORTEUR SAIN ELIMINE DANS SES MATIERES FECALES DES QUANTITES IMPORTANTES DE VIRUS ENTERIQUES, EVACUEES PAR DES EAUX USEES. CES VIRUS PEUVENT CONTAMINER DES CULTURES, DES ZONES DE LOISIRS OU DE CONCHYLICULTURE, POLLUER DES SOURCES D'EAU POTABLE. IL EXISTE UN RISQUE INFECTIEUX LORS DE LA BAIGNADE, LORS DE LA CONSOMMATION D'EAU DE BOISSON OU DE COQUILLAGES. LES MILIEUX HYDRIQUES POUVANT CONTENIR DES QUANTITES DE VIRUS EXTREMEMENT FAIBLES, IL EST NECESSAIRE D'UTILISER DES TECHNIQUES DE CONCENTRATION ET DE DETECTION PARTICULIEREMENT SENSIBLES. UNE METHODE UTILISANT DES MEMBRANES D'ULTRAFILTRATION TANGENTIELLE EN POLYSULFONE D'UN POIDS MOLECULAIRE NOMINAL DE 10#5, ELUEES EN FIN DE CONCENTRATION PAR UNE SOLUTION D'EXTRAIT DE BUF A 3%, NOUS A PERMIS DE RECUPERER 96% DE POLIOVIRUS ET 83% D'ECHOVIRUS A PARTIR DE 20 LITRES D'EAU CLAIRE ARTIFICIELLEMENT CONTAMINEE. UN APPAREIL PERMETTANT D'EXPLOITER CETTE METHODE SUR LE TERRAIN, LE CONCENTRATEUR HYDRIQUE AUTONOME D'ORGANISMES CONTAMINANTS (CHADOC) A ETE DEVELOPPE (BREVET NO 92-09.499). UTILISABLE DANS UN BATEAU PNEUMATIQUE DE TYPE ZODIAC#, IL PERMET LE PRELEVEMENT ET LA CONCENTRATION DE 60 LITRES D'EAU PAR HEURE, LA RECUPERATION DES PARASITES >5 DANS UN PREFILTRAT, DES BACTERIES DANS UN CONCENTRAT, DES VIRUS DANS UN ELUAT D'EXTRAIT DE BUF. L'ELUTION DOIT ETRE REALISEE A UN PH DE 9.5. LA SURVIE DES ENTEROVIRUS DANS L'ELUAT IMMEDIATEMENT NEUTRALISE N'EST POSSIBLE QU'A UNE TEMPERATURE INFERIEURE A 20C. LA DETECTION DES ENTEROVIRUS DANS LES EAUX A ETE POSSIBLE PAR UNE TECHNIQUE D'HYBRIDATION (DOT BLOT) UTILISANT DEUX SONDES FROIDES MARQUEES A LA DIGOXIGENINE. LA RIBOSONDE 5 NON CODANTE PERMET LA DETECTION DE TOUT LES ENTEROVIRUS, LA SONDE VP1 EST SPECIFIQUE DES TROIS TYPES DE POLIOVIRUS, LEUR SENSIBILITE EST DE 800 FG DE RNA. CES DIFFERENTES TECHNIQUES ONT ETE MISES EN UVRE POUR APPRECIER LE RISQUE EPIDEMIOLOGIQUE VIRAL LIE A LA BAIGNADE DANS LES EAUX DE L'ENVIRONNEMENT DE LA REGION RHONE-ALPES. PENDANT UN AN, 109 PLONGEURS ET 49 TEMOINS NON-PLONGEURS ONT ETE SUIVIS, LEURS ZONES D'ENTRAINEMENT SURVEILLEES SUR LE PLAN VIROLOGIQUE. A 9 REPRISES, DES ENTEROVIRUS ONT ETE DETECTES DANS LES EAUX EN HYBRIDATION MOLECULAIRE, ILS N'ONT PU ETRE ISOLES EN CULTURE CELLULAIRE QUE 3 FOIS. LE RISQUE INFECTIEUX VIRAL PENDANT L'ENQUETE NE S'EST PAS REVELE SUPERIEUR CHEZ LES PLONGEURS. LES TAUX D'ANTICORPS VIS-A-VIS DES 16 ENTEROVIRUS LES PLUS FREQUENTS DANS LA REGION ONT ETE DETERMINES PAR SERONEUTRALISATION. SEULS LES POURCENTAGES DE SEROPOSITIFS VIS-A-VIS DES COXSACKIE B4 ET B5 SE SONT AVERES SIGNIFICATIVEMENT PLUS ELEVES CHEZ LES PLONGEURS. POUR LE VIRUS DE L'HEPATITE A, LES TAUX DE SEROPROTECTION ETAIENT IDENTIQUES DANS LES DEUX POPULATIONS (TAUX: 17%; MOYENNE D'AGE: 24,5+/3,2 ANS). UNE TENTATIVE D'IMMUNISATION DE 195 JEUNES ADULTES CONTRE L'HEPATITE A AVEC LE VACCIN (160 UNITES) EN COURS DE DEVELOPPEMENT PAR LA SOCIETE PASTEUR MERIEUX SERUMS & VACCINS A PERMIS D'OBTENIR UNE SEROPROTECTION DANS 100% DES CAS (GMT 95 MIU/ML)
Author: Nicholas F Gray
Publisher: World Scientific
ISBN: 1783261188
Category : Technology & Engineering
Languages : en
Pages : 1442
Get Book Here
Book Description
This comprehensive text provides the reader with both a detailed reference and a unified course on wastewater treatment. Aimed at scientists and engineers, it deals with the environmental and biological aspects of wastewater treatment and sludge disposal.The book starts by examining the nature of wastewaters and how they are oxidized in the natural environment. An introductory chapter deals with wastewater treatment systems and examines how natural principles have been harnessed by man to treat his own waste in specialist reactors. The role of organisms is considered by looking at kinetics, metabolism and the different types of micro-organisms involved. All the major biological process groups are examined in detail, in highly referenced chapters; they include fixed film reactors, activated sludge, stabilization ponds, anaerobic systems and vegetative processes. Sludge treatment and disposal is examined with particular reference to the environmental problems associated with the various disposal routes. A comprehensive chapter on public health looks at the important waterborne organisms associated with disease, as well as removal processes within treatment systems. Biotechnology has had an enormous impact on wastewater treatment at every level, and this is explored in terms of resource reuse, biological conversion processes and environmental protection. Finally, there is a short concluding chapter that looks at the sustainability of waste water treatment. The text is fully illustrated and supported by over 3000 references./a
Author: Yung-Tse Hung
Publisher: World Scientific
ISBN: 9814327697
Category : Nature
Languages : en
Pages : 1256
Get Book Here
Book Description
This is a compilation of topics that are at the forefront of many technical advances and practices in air and water control. These include air pollution control, water pollution control, water treatment, wastewater treatment, industrial waste treatment and small scale wastewater treatment.
Author: Albert Bosch
Publisher: Elsevier
ISBN: 0080553273
Category : Science
Languages : en
Pages : 307
Get Book Here
Book Description
This book provides overviews and updates on basic research, diagnosis, epidemiology, and public health on enteric viruses, as well as on treatment and intervention to prevent their waterborne transmission. Data are presented and interpreted by leading researchers in the field in 13 chapters. An essential resource for virologists, epidemiologists, medical and public health professionals, graduate students and postdoctoral scientists at various levels of their careers.Key Topics Include:* Ecology of enteric viruses * Intervention measures from risk assessment to virus disinfection practices* Cutting edge technology on procedures for virus detection and monitoring in water and the water environment* Quality assurance and quality control measures in water virology* Legal regulations regarding viruses in the environment
Author:
Publisher:
ISBN:
Category : Communicable diseases
Languages : fr
Pages : 454
Get Book Here
Book Description
